Las redes peer-to-peer presentan varias desventajas:

1. Al no existir una administración de red centralizada, se dificulta determinar quién controla los recursos de la red.
2. Debido que no hay seguridad centralizada, cada computadora debe utilizar medidas de seguridad individuales para la protección de los datos.
3. La red resulta más compleja y difícil de administrar a medida que aumenta la cantidad de computadoras en la red.
4. Es posible que no haya un almacenamiento centralizado de los datos, por lo que se deben conservar individualmente copias de seguridad de los datos. Esta responsabilidad recae en los usuarios individuales.